Proyectos de Investigación:
Somos un laboratorio de investigación básica, es decir tratamos de contestar preguntas fundamentales sobre los microorganismos. Las que nos interesan son:
-¿Porqué algunas bacterias crecen tan lento y otras se dividen en pocos minutos?
-¿Qué factores de la organización del genoma impactan en la velocidad de crecimiento ?
-¿Se puede reprogramar el crecimiento bacteriano ?
Y más ampliamente...
-¿Cómo se relaciona la estructura del genoma y su organización espacial con la fisiología bacteriana?
Tenemos 2 modelos de estudio:
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Vibro cholerae el agente causal del cólera.
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Badyrhizobium simbionte de la soja, empleado para aumentar los rindes.
Estas bacterias son ejemplos extremos de velocidad de crecimiento. V. cholerae se divide cada 15-17 minutos, los Bradyrhizobios cada 7-20 hs. Buscamos qué patrones en la secuencia del genoma podrían jugar un rol. Por ejemplo, pudimos reprogramar el crecimiento del cólera alterando la localización de genes ribosomales.
Cómo lo hacemos?
Usamos técnicas de biologia molecular, genética, genómica, microscopía, microbiología, para poner a prueba experimetalmente observaciones y correlaciones provenientes de la bioinformática. En particular empleamos técnicas de recombinería (recombineering) para editar y reorganizar de manera racional y precisa el genoma bacteriano.
Aislamiento de Bradyrhizobio
V. cholerae es una de las bacterias de multiplicacion más veloz que se conocen. En verde V. cholerae que se divide cada 15-17 minutos. Fíjense como crece mucho más que E. coli que lo hace cada 40. Tendrá un rol en su patogenicidad?
La posición genómica de S10 determina la dosis del locus su expresividad y determina la velocidad de crecimiento (µ) de V. cholerae. a) Mediante edición del genoma se reubicó S10 (flecha naranja) en diferentes sitios del genoma generándose una colección de cepas que permite estudiar la relación localización-fenotipo. b) Determinación de la velocidad de crecimiento (negro, eje izquierdo), la dosis (gris, ordenada derecha) y la expresión (blanco, eje derecho) de S10 en las diferentes cepas. Se observa una fuerte correlación de las 3 variables con la posición genómica de S10 (abscisa).
